En 639 à la mort de son père, il devient roi de Neustrie et règne sous l'autorité de sa mère Nanthilde et du Aega, maire du palais.
Il est le premier roi à préférer au cheval, la voiture attelée à quatre boeufs. De là vient sûrement l'image des " Rois fainéants ", allongés dans des chars à boeufs. il laisse son maire décider a sa place. Le maire du palais, dont le titre est héréditaire, a le contrôle de l'armée et de la justice.
Clovis meurt à 24 ans en 657. Il est inhumé à l'abbaye de Saint-Denis.
Mariée en 649 au roi Clovis II, la reine Bathilde exerce la régence à la mort de Clovis, pour son fils Clotaire III.